Deze website maakt gebruik van cookies

Deze website toont video’s van YouTube. Deze partij plaatst cookies (third party cookies). Als u deze cookies niet wilt, dan kunt u dat hier aangeven. U kunt dan geen video’s op deze website zien. Wij plaatsen zelf ook cookies om onze site te verbeteren. Deze gegevens worden niet aan derden verstrekt. Lees meer over het cookiebeleid

Deze website maakt gebruik van cookies om video's te tonen en het gebruikersgemak te verbeteren. Als u deze cookies niet wilt, dan kunt u dat hier aangeven. Lees meer over het cookiebeleid

Ga direct naar de inhoud, het hoofdmenu, het servicemenu of het zoekveld.

Twee ZonMW TOP subsidies voor genetisch onderzoek

23feb 2017

Terug naar het overzicht

Antoni van Leeuwenhoek onderzoekers Reuven Agami, Wilbert Zwart en Lodewyk Wessels ontvangen een ZonMW TOP subsidie. Agami en Zwart krijgen 675.000 euro om bij hormoon-gerelateerde tumoren op zoek te gaan naar zogenoemde enhancer elementen die de activiteit van genen beïnvloeden. Wessels krijgt samen met Mark van der Wiel van het VUMC 675.000 euro om te kijken hoe Big Data technieken kunnen worden ingezet om nieuwe biomarkers te vinden.

DNA

Kanker is een probleem van het DNA. Genetisch onderzoek is daarom van essentieel belang om kanker beter te kunnen begrijpen en aan te pakken. Zo kunnen genetische eigenschappen van tumoren gebruikt worden als 'biomarkers': je kunt het gebruiken voor de diagnose, en ook om te voorspellen hoe succesvol verschillende behandelingen zullen zijn.

Grote datasets

Een probleem bij het zoeken naar biomarkers is dat moleculaire data veel informatie bevat. Bij de speurtocht naar nieuwe biomarkers moeten vele genetische gegevens van het liefst zo veel mogelijk patiënten worden geanalyseerd. Daarnaast kunnen allerlei andere gegevens, zoals die van proeven met tumoren in laboratoria, ook van belang zijn. Computationeel bioloog Lodewyk Wessels gaan in samenwerking met statisticus Mark van der Wiel en Marcel Reinders en Marco Loog  van de TU Delft nieuwe methodes ontwikkelen om met deze grote datasets om te gaan. Hierbij maken ze gebruik van technieken uit machine learning en statistiek. Met hun TOP subsidie gaan zij deze technieken inzetten om op zoek te gaan naar biomarkers die belangrijk zijn voor de vroege diagnose van orale kankers en baarmoederhalskanker. Ook gaat zij zoeken naar biomarkers die het succes van verschillende soorten behandelingen bij borstkanker en darmkanker voorspellen.

Enhancers

Ons DNA bestaat maar voor een klein deel uit genen, stukjes DNA die coderen voor eiwitten en die alle processen in onze cellen en ons lichaam regelen. We hebben er hiervan zo'n 20.000. Maar hiernaast bevat ons menselijke genoom heel veel DNA waarvan de functie vaak niet duidelijk is: maar liefst 95% bevat géén genen. De laatste jaren wordt steeds duidelijker dat dit niet-coderende DNA wel degelijk cruciaal is. Het bevat onder meer gebieden, zogenoemde enhancers, die de activiteit van genen reguleren.

Opsporen

Kanker kan ontstaan doordat er een fout in bepaalde genen is geslopen, maar ook door fouten in de enhancer-gebieden die genen reguleren. Reuven Agami en Wilbert Zwart hebben een techniek ontwikkeld om dit soort enhancers op te sporen. Zij zullen hun TOP subsidie inzetten om voor twee hormonale typen kanker - hormonale borstkanker en prostaatkanker - te kijken welke enhancers een cruciale rol spelen bij de tumorgroei en bij resistentie tegen behandeling. Op termijn moet dit leiden tot het verbeteren van de diagnose van de tumoren en tot nog nauwkeurigere behandeling op maat.

Deel dit onderwerp
 
 
contact
020 512 9111
We helpen u graag verder